Il borgo medievale di Zuccarello fu fondato il 4 aprile del 1248 dai marchesi di Clavesana - Bonifacio III, Emanuele I e Francesco I - e dalla popolazione della val Neva; l'atto di fondazione è ancora oggi conservato presso l'archivio storico del Comune. A causa della forte posizione strategica fu più volte conteso tra le varie fazioni nobiliari.
Ceduto alla famiglia dei Del Carretto tra il 1326 e il 1335, divenne sede del marchesato locale (Marchesato di Zuccarello) annettendosi territori e villaggi vicini nei propri confini. La Repubblica di Genova acquisterà tra il 1624 e il 1633 il marchesato versando 200 mila fiorini. Il nuovo possedimento genovese scatenò la protesta dei Savoia e dei suoi alleati francesi dando inizio nel 1625 ad una guerra contro la repubblica genovese.